महाराष्ट्रातील कृषि उत्पादनाच्या विपणन कार्याचे नियमन करण्यासाठी पणन संचालनालय हे कार्यालय जबाबदार आहे. कृषी उत्पन्न बाजार समित्यांमध्ये (एपीएमसी) विकल्या जाणा-या शेतमालाला योग्य दर मिळवा यासाठी हे कार्यालय राज्यातील कृषी उत्पन्न बाजार समित्यां एकूणच व्यवहार व उपक्रमांचे संनियंत्रण करते. तसेच हा विभाग सरकारला कृषी उत्पादनांच्या बाजारात उत्पादनांच्या किमतींचे नियमन करण्यास सक्षम करतो जेणे करून ग्राहकांना वाजवी किमतीत उत्पादने उपलब्ध होतील. महाराष्ट्र सहकारी संस्था कायदा १९६० अंतर्गत नोंदणीकृत विविध विपणन, ग्राहक, कृषी प्रक्रिया, खरेदी विक्री संस्था, कॉटन जिनिंग आणि प्रेसिंग सोसायटी इत्यादी सहकारी संस्थाच्या कामांचे नियंत्रण या विभाग मार्फत होते. गरजांवर आधारित बाजार सुधारणांची अंमलबजावणी आणि वैकल्पिक विपणन वाहिन्यांची देखरेखदेखील या विभागाच्या कार्यक्षेत्रात येते.